記者1月27日從中國科學(xué)院大連化學(xué)物理研究所獲悉，該所研究員葉明亮團隊和中國科學(xué)院上海藥物研究所研究員羅成團隊合作，利用蛋白質(zhì)在結(jié)合配體后局部穩(wěn)定性的變化，開發(fā)了一種在復(fù)雜體系中可以同時鑒定配體結(jié)合蛋白和結(jié)合位點的蛋白質(zhì)組學(xué)分析新方法——PELSA方法。該方法無需對配體進行化學(xué)修飾，適用于包括藥物、代謝物、污染物等不同結(jié)構(gòu)配體的靶蛋白質(zhì)鑒定，將為藥學(xué)、基礎(chǔ)生物學(xué)、環(huán)境毒理學(xué)等領(lǐng)域提供新的研究工具。相關(guān)成果日前發(fā)表在《自然·方法》上。
葉明亮介紹，生物體仿佛擁有一套精密的“鑰匙”與“鎖”的系統(tǒng)，其中的“鑰匙”便是各式各樣的配體分子，而“鎖”則是蛋白質(zhì)上那些特定的結(jié)合位點。充分了解和“捕捉”生物分子的“配對”蛋白質(zhì)及“配對”位點，對認(rèn)識復(fù)雜生命體系、解析疾病機制、推動藥物研發(fā)等具有重要意義。然而，生物體內(nèi)約有兩萬多個基因，通過可變剪切、翻譯后修飾等又可以組成更為復(fù)雜的蛋白質(zhì)，一一排查如同大海撈針。傳統(tǒng)鑒定方法缺乏普適性，很難鑒定相互作用較弱的靶蛋白。
而此次，研究人員開發(fā)的PELSA方法能在復(fù)雜的蛋白質(zhì)混合體系中高靈敏度地鎖定發(fā)生能量變化的蛋白及其區(qū)域，并能夠測出配體與蛋白的局部結(jié)合親和力。PELSA方法具有較高的鑒定靈敏度，與目前廣泛使用但缺乏結(jié)合位點信息的熱蛋白質(zhì)組技術(shù)（TPP）相比，該方法的靶蛋白鑒定靈敏度提高了2.4倍。研究人員將PELSA方法用于藥物、金屬離子、抗體等多種配體的結(jié)合蛋白鑒定，發(fā)現(xiàn)其均展現(xiàn)出高靈敏的靶蛋白鑒定性能和精準(zhǔn)的結(jié)合區(qū)域定位能力，證明了PELSA方法可以作為一個通用的分析方法。此外，團隊還將PELSA方法應(yīng)用于葉酸、亮氨酸、富馬酸及琥珀酸等代謝物的作用蛋白鑒定，展示了該方法的廣譜適用性。
PELSA方法能夠直接在復(fù)雜體系中高靈敏度地識別配體結(jié)合蛋白，高分辨率地精確定位結(jié)合位點，在代謝物、藥物及污染物的識別及作用機制解析等領(lǐng)域具有廣闊的應(yīng)用前景。
據(jù)了解，未來，研究團隊希望與國內(nèi)外公司、高校、醫(yī)院等展開深入合作，推動PELSA方法的應(yīng)用，使其成為醫(yī)藥、環(huán)境等領(lǐng)域研究的利器。
記者1月27日從中國科學(xué)院大連化學(xué)物理研究所獲悉，該所研究員葉明亮團隊和中國科學(xué)院上海藥物研究所研究員羅成團隊合作，利用蛋白質(zhì)在結(jié)合配體后局部穩(wěn)定性的變化，開發(fā)了一種在復(fù)雜體系中可以同時鑒定配體結(jié)合蛋白和結(jié)合位點的蛋白質(zhì)組學(xué)分析新方法——PELSA方法。該方法無需對配體進行化學(xué)修飾，適用于包括藥物、代謝物、污染物等不同結(jié)構(gòu)配體的靶蛋白質(zhì)鑒定，將為藥學(xué)、基礎(chǔ)生物學(xué)、環(huán)境毒理學(xué)等領(lǐng)域提供新的研究工具。相關(guān)成果日前發(fā)表在《自然·方法》上。
葉明亮介紹，生物體仿佛擁有一套精密的“鑰匙”與“鎖”的系統(tǒng)，其中的“鑰匙”便是各式各樣的配體分子，而“鎖”則是蛋白質(zhì)上那些特定的結(jié)合位點。充分了解和“捕捉”生物分子的“配對”蛋白質(zhì)及“配對”位點，對認(rèn)識復(fù)雜生命體系、解析疾病機制、推動藥物研發(fā)等具有重要意義。然而，生物體內(nèi)約有兩萬多個基因，通過可變剪切、翻譯后修飾等又可以組成更為復(fù)雜的蛋白質(zhì)，一一排查如同大海撈針。傳統(tǒng)鑒定方法缺乏普適性，很難鑒定相互作用較弱的靶蛋白。
而此次，研究人員開發(fā)的PELSA方法能在復(fù)雜的蛋白質(zhì)混合體系中高靈敏度地鎖定發(fā)生能量變化的蛋白及其區(qū)域，并能夠測出配體與蛋白的局部結(jié)合親和力。PELSA方法具有較高的鑒定靈敏度，與目前廣泛使用但缺乏結(jié)合位點信息的熱蛋白質(zhì)組技術(shù)（TPP）相比，該方法的靶蛋白鑒定靈敏度提高了2.4倍。研究人員將PELSA方法用于藥物、金屬離子、抗體等多種配體的結(jié)合蛋白鑒定，發(fā)現(xiàn)其均展現(xiàn)出高靈敏的靶蛋白鑒定性能和精準(zhǔn)的結(jié)合區(qū)域定位能力，證明了PELSA方法可以作為一個通用的分析方法。此外，團隊還將PELSA方法應(yīng)用于葉酸、亮氨酸、富馬酸及琥珀酸等代謝物的作用蛋白鑒定，展示了該方法的廣譜適用性。
PELSA方法能夠直接在復(fù)雜體系中高靈敏度地識別配體結(jié)合蛋白，高分辨率地精確定位結(jié)合位點，在代謝物、藥物及污染物的識別及作用機制解析等領(lǐng)域具有廣闊的應(yīng)用前景。
據(jù)了解，未來，研究團隊希望與國內(nèi)外公司、高校、醫(yī)院等展開深入合作，推動PELSA方法的應(yīng)用，使其成為醫(yī)藥、環(huán)境等領(lǐng)域研究的利器。
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